黒い水ぶくれのようなものが右の頬の粘膜の所に出来たのは口内炎なのでしょうか？ そして、放置して自然に治るのでしょうか？

おそらく口内炎の可能性があります。放置して自然治癒を待つのではなく、口内炎の症状が出たら、早めに歯科医に行って診断を受けて、抗生物質などの治療を受けることをお勧めします。