水月池のギミックについて、経電石3つを持ってきて雷霊が自動的に反応するはずなのに、繋がらないという問題があります。バグでしょうか？再起動しても直りません。

おそらくソフトウェアのバグではなく、ハードウェアの故障の可能性が高いです。雷霊の繋がらない問題がある場合は、電源を落として再起動してみてください。既に再起動してもダメなら、本体の修理に出すか新しい部品を購入する必要があるかもしれません。