株式会社SECから借り入れのFAXがきたが、詐欺の会社である可能性はありますか？

おそらく詐欺の会社でない可能性が高いと思われます。株式会社SECの正規の業務を行っており、信用力のある企業であると考えられます。また、FAXでの申請手続きは大変無礼なものとして認識されるため、本物の正規の業者である可能性が高いと考えられます。なお、念のため、必要な証明書類が期待される場合がありますので、事前にそれらをうかがっておくことをお勧めします。