22歳の男性ですが、昼過ぎから喉に違和感があり、夜になって片方の扁桃腺が腫れていることを確認できました。 このとき、痛みは重くはないものの、嚥下するときに腫れている側に多少不快感を覚えますか？

はい、おそらくは不快感を覚える可能性があります。扁桃腺が腫れている場合、嚥下時に違和感を伴うことがあります。しかし、重症でない限り、危険な状態ではありませんので、お医者さんに詳しい相談をお勧めします。