アニメーションのリターゲットについて、キャラクターのボーンを合わせることで全てのアニメーションをリターゲットできるかどうか。

いいえ、キャラクターのボーンを合わせることでは、すべてのアニメーションをリターゲットすることはできません。可能な限り最高の効果を得るためには、各種の補完を行う必要があります。効率的なリターゲットアニメーションを行う場合は、モーションキャプチャを使用することをお勧めします。