京都駅の期間限定京アニグッズストアでの支払い方法については、一般的な公式発表や情報源からの具体的な情報が提供されていないため、現時点で具体的な情報を提供することはできません。
ただし、一般的には多くの店舗で一般的な支払い方法が受け入れられています。現金、クレジットカード（VISA、MasterCardなど）、デビットカード、電子マネー（Suica、PASMOなど）などが一般的な支払い方法として考えられます。
期間限定の店舗やイベントの場合、支払い方法が限定される場合がありますので、該当の公式ウェブサイトやSNSアカウントを確認するか、関連する情報を問い合わせることをおすすめします。また、店舗内に設置されている案内板や受付などからも情報を入手することができる場合があります。
上記に加えて、京都駅周辺には多くのATMや銀行がありますので、現金が必要な場合でも安心です。
最新かつ正確な情報を入手するためには、公式な情報源や関連する情報を確認することをおすすめします。どうぞ、楽しいお買い物となりますように。