はい、名鉄の学割乗車券を利用して、豊橋(本線)東枇杷島(犬山線)新鵜沼(各務原線)岐阜(本線)須ヶ口(津島線)津島(尾西線)弥富の経路で乗車することはできます。
名鉄の学割乗車券は、名鉄電車(本線、犬山線、各務原線、津島線、尾西線など)を利用することができます。経路を変更する場合にも、学割乗車券を使用することができますので、問題ありません。
ただし、具体的な時刻や運行状況によっては、乗り換えの時間が短くなり、乗り換えに制限が生じる可能性もありますので、事前に時刻表や運行情報を確認することをおすすめします。